Les écoles doctorales organisent la formation des docteurs et les préparent à leur insertion professionnelle. Elles apportent aux doctorants une culture pluridisciplinaire dans le cadre d'un projet scientifique cohérent. Les écoles doctorales rassemblent des unités et des équipes de recherche reconnues après une évaluation nationale.
Il y a en Alsace quatre écoles doctorales dans les domaines des matériaux et des nanosciences :

• L’Ecole Doctorale Jean-Henri Lambert fédère 13 formations doctorales au sein de 16 laboratoires de recherche sur le site de Mulhouse. Elle dépend de l’Université de Haute Alsace (UHA)

• L’Ecole doctorale de sciences chimiques est l’école doctorale dépendant de la faculté de chimie de l’Université Louis Pasteur de Strasbourg (ULP) et fédère les onze unités ayant une ou plusieurs équipes qui en dépendent.

• L’Ecole doctorale de physique et chimie physique regroupe actuellement 6 laboratoires d’accueil issus du CNRS, de l’Université Louis Pasteur et de l’INSERM.

• L’Ecole doctorale MSII (mathématique et sciences de l’information et de l’ingénieur) dépend de l’UFR de sciences physiques de l’université Louis Pasteur de Strasbourg. Elle regroupe les doctorants, chercheurs et enseignants-chercheurs issus ou liés à certaines mentions du Master de Sciences.

L'ADDAL

En plus des écoles doctorales, il y a l’ADDAL, la dynamique association des doctorants alsaciens. Parmi ses actions, elle soutient l’insertion des docteurs dans les entreprises et organise de rencontres avec des chefs d’entreprises afin de permettre aux docteurs de préparer au mieux la poursuite d’une carrière dans le monde industriel.